Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TsksO54887 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TsksO54887 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TsksO54887 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TsksO54887 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TsksO54887 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TsksO54887 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms