Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pik3cdO35904 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms