Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sp100O35892 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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