Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms