Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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