Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms