Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf6O08584 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Klf6O08584 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klf6O08584 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms