Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms