Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms