Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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