Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20918J3QN17 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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