Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a18J3QN01 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ms4a18J3QN01 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms