Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21863J3KMP8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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