Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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