Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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