Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5160F8VPN3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms