Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M1F7CXU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-M1F7CXU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M1F7CXU4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2-M1F7CXU4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2-M1F7CXU4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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