Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5861F6VCN9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5861F6VCN9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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