Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms