Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cald1E9QA15 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms