Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc146E9Q9F7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms