Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd35E9Q9D8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms