Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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