Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms