Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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