Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Ccdc171E9Q1U1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc171E9Q1U1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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