Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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