Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms