Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms