Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx60E9PZQ1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms