Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ryr1E9PZQ0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms