Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms