Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms