Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms