Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5934D3Z4U6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms