Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms