Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pgbd5D3YZI9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms