Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms