Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm17333C6EQI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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