Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms