Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20547B8JJN0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20547B8JJN0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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