Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11cB4XVP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf11cB4XVP9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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