Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms