Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms