Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apba1B2RUJ5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms