Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt4B2RU40 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms