Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apol7aB2RT54 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms