Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf518bB2RRE4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf518bB2RRE4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms