Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brpf3B2KF05 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms