Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp40B1B1D3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp40B1B1D3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp40B1B1D3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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